Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA8P53708 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms