Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PGGT1BP53609 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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