Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK4P51957 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK4P51957 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK4P51957 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK4P51957 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK4P51957 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK4P51957 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK4P51957 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK4P51957 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms