Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP5P45974 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP5P45974 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP5P45974 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP5P45974 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP5P45974 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP5P45974 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP5P45974 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP5P45974 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms