Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms