Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms