Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms