Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCKARP32238 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCKARP32238 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms