Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARCKSP29966 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms