Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD34P28906 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD34P28906 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD34P28906 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms