Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXP28300 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXP28300 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXP28300 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXP28300 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms