Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PLNP26678 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLNP26678 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLNP26678 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms