Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO1P25800 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO1P25800 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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