Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HRCP23327 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HRCP23327 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HRCP23327 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HRCP23327 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HRCP23327 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HRCP23327 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HRCP23327 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HRCP23327 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HRCP23327 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HRCP23327 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HRCP23327 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HRCP23327 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HRCP23327 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HRCP23327 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HRCP23327 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HRCP23327 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HRCP23327 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms