Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKACBP22694 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKACBP22694 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms