Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms