Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB3P14651 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms