Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms