Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLBP1P12271 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms