Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VSIG8P0DPA2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSIG8P0DPA2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms