Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms