Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms