Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP10P09238 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP10P09238 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP10P09238 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms