Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms