Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms