Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CLDN9O95484 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CLDN9O95484 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CLDN9O95484 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN9O95484 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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