Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPBO95292 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPBO95292 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPBO95292 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPBO95292 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms