Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms