Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms