Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRMUO75648 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRMUO75648 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRMUO75648 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms