Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ZNF814-213ENST00000597832 2090 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RASGRP4-217ENST00000615439 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NDUFS4-204ENST00000506974 833 ntTSL 1 (best)10.61□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLAA-201ENST00000397292 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SPARC-209ENST00000539687 511 ntTSL 510.6□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UGP2-225ENST00000495020 472 ntTSL 410.6□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 THADA-215ENST00000474159 1975 ntTSL 510.6□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SPIDR-202ENST00000517619 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.58□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EMP3-201ENST00000270221 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM92A-213ENST00000521641 780 ntTSL 310.58□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SP2-205ENST00000637943 481 ntTSL 210.55□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TBC1D5-210ENST00000429924 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBBP8-204ENST00000399722 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 METTL2A-202ENST00000333483 1556 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARHGAP25-210ENST00000481684 908 ntTSL 310.47□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PTK2B-206ENST00000461615 427 ntTSL 210.46□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 210.46□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF143-217ENST00000533542 627 ntTSL 410.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF143-216ENST00000532577 548 ntTSL 410.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM92A-205ENST00000518116 1943 ntTSL 510.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZDHHC14-206ENST00000517432 3646 ntTSL 210.43□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARMCX5-GPRASP2-209ENST00000602463 561 ntTSL 410.43□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDADC1-202ENST00000429346 290 ntTSL 310.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCNDBP1-210ENST00000566882 2746 ntTSL 210.4□□□□□ -0.742e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DCLRE1C-201ENST00000357717 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NDUFS4-202ENST00000502423 562 ntTSL 510.38□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ELP4-215ENST00000638984 1330 ntTSL 510.36□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRIM5-208ENST00000465634 602 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHB-212ENST00000512041 694 ntTSL 310.35□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHB-203ENST00000419140 907 ntTSL 510.35□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABI2-211ENST00000422511 2718 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 310.32□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SSH1-205ENST00000546812 588 ntTSL 310.31□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 STRIP1-203ENST00000461054 577 ntTSL 310.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SFI1-222ENST00000478887 662 ntTSL 410.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PPIA-202ENST00000415933 863 ntTSL 210.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 510.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EMP3-203ENST00000594198 263 ntTSL 210.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)10.27□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAX8-AS1-215ENST00000616073 512 ntTSL 410.27□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RSPRY1-201ENST00000394420 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHB-205ENST00000446735 732 ntTSL 510.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SIL1-206ENST00000505353 442 ntTSL 310.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EIF3L-213ENST00000482600 1294 ntTSL 510.25□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 L3MBTL2-201ENST00000216237 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ILF3-205ENST00000586544 3859 ntTSL 1 (best)10.24□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 INPP5B-209ENST00000474758 572 ntTSL 510.24□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMTC4-202ENST00000342624 3602 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LIMA1-211ENST00000552338 555 ntTSL 410.23□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 IMPDH2-204ENST00000462980 908 ntTSL 210.23□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBR1-210ENST00000569337 549 ntTSL 510.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIAA0319L-220ENST00000494948 766 ntTSL 410.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARHGAP25-214ENST00000491237 582 ntTSL 410.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF678-205ENST00000608949 929 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM13A-222ENST00000515600 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COG7-204ENST00000566364 939 ntTSL 210.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CS-205ENST00000546891 911 ntTSL 210.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-202ENST00000393785 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXO18-205ENST00000461504 835 ntTSL 510.14□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC10.12□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 USP43-203ENST00000570827 3624 ntTSL 210.12□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMTC3-204ENST00000551088 646 ntTSL 310.11□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARL8A-203ENST00000491358 355 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PIP4K2A-203ENST00000422321 768 ntTSL 310.11□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP70-210ENST00000481834 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EXOSC8-205ENST00000474661 738 ntTSL 510.09□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SPARC-205ENST00000522348 497 ntTSL 310.09□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EXOSC8-208ENST00000488779 630 ntTSL 510.09□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ESPN-208ENST00000475479 360 ntTSL 310.08□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CHN2-206ENST00000410098 918 ntTSL 210.08□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF143-208ENST00000438144 644 ntTSL 310.07□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OAT-206ENST00000490096 579 ntTSL 510.06□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBE2R2-AS1-201ENST00000454429 647 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ACAD8-214ENST00000531338 3315 ntTSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF799-204ENST00000595766 576 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CD99L2-204ENST00000418547 965 ntTSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LIN52-201ENST00000553404 2339 ntTSL 210.04□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 INTS4-206ENST00000529807 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 METTL16-206ENST00000574623 759 ntTSL 310.04□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SERP1-204ENST00000484608 632 ntTSL 310.04□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIAA1841-203ENST00000402291 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTF3C5-210ENST00000489842 696 ntTSL 210.01□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SIPA1L3-211ENST00000601222 546 ntTSL 410□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LIN52-204ENST00000554938 566 ntTSL 49.99□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DET1-203ENST00000557837 1925 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-203ENST00000462705 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 137.9
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