Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX15O60248 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms