Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL3O43909 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms