Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AKAP8O43823 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKAP8O43823 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms