Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH3O43739 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH3O43739 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms