Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HTATSF1O43719 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms