Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR46O15213 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR46O15213 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR46O15213 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR46O15213 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR46O15213 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR46O15213 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms