Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms