Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms