Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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USP27XA6NNY8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP27XA6NNY8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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