Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF804BA4D1E1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms