Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf170A2RU37 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms