Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms