Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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