Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms