Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms