Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A4Q9UP95 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A4Q9UP95 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A4Q9UP95 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A4Q9UP95 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A4Q9UP95 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC12A4Q9UP95 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms