Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms