Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF2Q9UG63 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms