Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms